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Retour sur les Journées Portes Ouvertes organisées par l’APBM Association pour le Progrès de la Biologie Médicale dans toute la France. Depuis plus d’un an, les membres de l’APBM, dont nous faisons partie, qui fédère 85 % des laboratoires privés français, jouent un rôle majeur dans la lutte contre la COVID-19. Un rôle clé et parfois méconnu au sein du système de santé. Mais cette capacité d’innovation va bien au-delà de l’actuelle pandémie et répond aussi à des enjeux de moyen et long terme dans de très nombreux domaines médicaux.

Pour le réseau Les Biologistes Indépendants, c’est le plateau technique OuiLab LBI, de Laxou qui a été mis en lumière lors de la visite des journalistes.

Le laboratoire LES BIOLOGISTES INDEPENDANTS OuiLab, membre fondateur du réseau, a investi début 2021, pour l’ensemble du groupe, dans une plateforme de séquençage haut-débit entièrement automatisée. C’est sur le plateau technique de Laxou (54), sous la responsabilité de Charlotte FELICI, Biologiste spécialisée et agréée en Génétique Moléculaire, qu’un séquenceur Illumina et deux robots Hamilton ont été installés.

L’ADN et l’ARN, composés de nucléotides, sont le support de l’information génétique qui régit la reproduction et la croissance des êtres vivants. Le séquençage haut-débit ou next-generation sequencing (NGS) est une technique de biologie moléculaire de pointe permettant de déterminer la composition des molécules d’ADN ou d’ARN et
de connaitre ainsi l’ordre unique et spécifique des nucléotides qui les composent. On utilise le terme « haut-débit » car de nombreuses séquences (jusqu’à plusieurs millions) peuvent être analysées en même temps. Cette technique permet de séquencer de façon routinière des génomes entiers, des exomes (ensemble des régions codantes du génome humain), ou des panels de gènes cibles.

Dans un premier temps, la plateforme a été dédiée au séquençage du génome du coronavirus SARSCoV-2. L’objectif était d’accompagner les Autorités de santé dans leur volonté d’identification, de surveillance et d’étude des variants en complétant les efforts des centres nationaux de référence pour séquencer à plus grande échelle sur le territoire national.
Le séquençage génomique du SARS-CoV-2 permet de lire l’intégralité de la carte d’identité génétique du virus et d’identifier ses mutations. Cette technique permet de mettre en évidence et de suivre la propagation de nouveaux variants. C’est donc un outil incontournable pour la maîtrise de l’épidémie, pour retarder la diffusion du virus, anticiper les capacités diagnostiques et, éventuellement, la stratégie vaccinale.

Actuellement, le séquençage est utilisé dans de très nombreux domaines : en génétique constitutionnelle prénatale, afin de déceler des maladies génétiques avant la naissance d’un enfant, et postnatale chez des personnes symptomatiques ou non, en oncologie pour typer et suivre l’évolution des tumeurs cancéreuses, en pharmacogénétique pour adapter une thérapie
médicamenteuse selon les spécificités génétiques d’une personne, ou encore, en microbiologie pour l’étude des microorganismes.

Le laboratoire élargira très prochainement les applications de sa plateforme vers l’oncologie via le séquençage du génome de cellules tumorales. Les analyses en oncologie donneront accès à des informations essentielles pour une évaluation pronostique et thérapeutique optimale. Les patients atteints de cancer pourront ainsi avoir accès à une meilleure prise en charge par à une adaptation personnalisée de leur traitement. L’importance croissante de la génétique dans la médecine nourrit notre ambition de développer et de favoriser davantage l’accès aux analyses génétiques pour tous.