Une technologie de pointe pour une recherche approfondie des mutations du SARS-CoV2
Fort de 650 sites de proximité et de plus de 1000 biologistes médicaux répartis sur le territoire national, le réseau Les Biologistes Indépendants dispose désormais d’une plateforme de séquençage haut débit totalement automatisée.
Dès début 2021, le laboratoire EspaceBio, membre fondateur du réseau, a décidé d’investir dans cette technologie de pointe pour l’ensemble du groupe. C’est sur le plateau technique de Laxou, sous la responsabilité de Charlotte FELICI, Biologiste spécialisée et agréée en Génétique Moléculaire, qu’un séquenceur Illumina et deux robots Hamilton ont été installés.
Le séquençage haut débit permet de lire l’intégralité de la carte d’identité génétique du virus et d’identifier ainsi de nouvelles mutations (par opposition à la technique de PCR ne pouvant identifier que quelques mutations bien précises). Utilisée principalement dans les centres hospitaliers universitaires, cette technologie est peu présente dans les laboratoires de biologie médicale du secteur privé.
Depuis le début de l’épidémie, les laboratoires privés appellent à collaborer avec les services de biologie publics en matière de séquençage. En effet, il est important de conjuguer nos forces pour combler le retard de la France par rapport à ses voisins européens qui séquencent beaucoup plus. On peut citer, en exemple, le Danemark ou le Royaume Uni, qui séquencent respectivement 20% et 5% des résultats positifs de PCR. Autre exemple, les USA qui ont investi 1 milliard de dollars pour le séquençage du COVID.
Le choix d’EspaceBio s’est porté sur la technologie NGS Illumina permettant une grande adaptabilité et de multiples applications. Opérationnelle depuis mi-avril, cette plateforme est, pour le moment, dédiée à la COVID, et permettra d’améliorer les capacités nationales de séquençage. De ce fait, les laboratoires du groupe participeront activement à la veille épidémiologique, au suivi de l’évolution du virus et de ses conséquences.
D’ici début 2022, nos laboratoires élargiront les applications du séquençage haut débit vers des recherches en génétique tumorale et infectieuse. Ainsi, nous pourrons par exemple, par analyse des caractéristiques génétiques de cellules tumorales, fournir des informations essentielles à une évaluation pronostique et thérapeutique optimale. Cette technologie de pointe permettra, par une adaptation personnalisée du traitement thérapeutique, une meilleure prise en charge des patients atteints de cancers